Antimicrobial susceptibility of Streptococcus pneumoniae isolated from patients in the northeastern macroregion of São Paulo state, Brazil, 1998-2013 / Suscetibilidade antimicrobiana de Streptococcus pneumoniae isolados de pacientes na macrorregião nordeste do estado de São Paulo, Brasil, entre 1998 e 2013

ABSTRACT Introdution: There are reports worldwide about the increase in infections caused by Streptococcus pneumoniae resistant to antimicrobials. Objective: Evaluate the susceptibility profile of serotypes of Streptococcus pneumoniae associating them with pneumococcal invasive diseases (PID), as well as antimicrobial therapies. Method: This is a retrospective cross-sectional research involving secondary data from 1998 to 2013, in the northeastern macroregion of São Paulo state, Brazil, composed of Araraquara, Barretos, Franca and Ribeirão Preto regions, with 90 municipalities. At Instituto Adolfo Lutz (IAL), isolated strains from patients with PID were subjected to identification, serotyping and antimicrobial susceptibility testing. Results: From 796 strains analyzed, 14.8% (n = 118) were resistant to penicillin, being 3% (n = 24) with intermediate resistance and 11.8% (n = 94) with full resistance, especially in patients with meningitis. Moreover, resistance to ceftriaxone was 5.3%: 34 (4.3%) with intermediate resistance and 8 (1%) with full resistance. We point out that the greatest level of resistance profiles was observed against sulfamethoxazole/trimethoprim (SMT): 350 (49.4%). On the other hand, antimicrobial susceptibility was described above 90% to chloramphenicol: 99.6% (n = 696), erythromycin: 94.7% (n = 664), ceftriaxone: 94.7% (n = 754) and fully susceptible to vancomycin. Among the 18 most common serotypes, 9V and 14 showed less susceptibility to SMT, to penicillin and ceftriaxone; 19A to SMT and penicillin; 1 to SMT; 12F and 3 to chloramphenicol; 6A to SMT; 6B 23F to erythromycin and penicillin. Conclusion: Monitoring of Streptococcus pneumoniae antimicrobial resistance is essential to guide the appropriate empirical treatment of pneumococcal disease.

RESUMO Introdução: Em todo o mundo existem relatos de aumento das infecções causadas por Streptococcus pneumoniae resistentes aos antimicrobianos. Objetivo: Avaliar o perfil de suscetibilidade dos sorotipos de Streptococcus pneumoniae, associando-os com as doenças invasivas pneumocócicas (DIP), bem como com as terapias antimicrobianas. Método: Trata-se de um seguimento retrospectivo com enfoque em dados secundários de 1998 a 2013, na macrorregião nordeste do estado de São Paulo, Brasil, composta pelas regiões de Araraquara, Barretos, Franca e Ribeirão Preto, com 90 municípios. No Instituto Adolfo Lutz (IAL), as cepas isoladas de pacientes com DIP foram submetidas a identificação, sorotipagem e teste de suscetibilidade aos antimicrobianos. Resultados: Das 796 cepas analisadas, 14,8% (n = 118) apresentaram resistência a penicilina, sendo 3% (n = 24) com resistência intermediária e 11,8% (n = 94) com resistência plena, principalmente em pacientes com meningite. Para ceftriaxona, a resistência foi de 5,3%: 34 (4,3%) com resistência intermediária e 8 (1%) com resistência plena. Há de salientar que o maior nível de resistência das cepas foi observado para sulfametoxazol/trimetoprima (SMT): 350 (49,4%). Por outro lado, a suscetibilidade foi descrita acima de 90% para cloranfenicol: 99,6% (n = 696); eritromicina: 94,7% (n = 664); ceftriaxona: 94,7% (n = 754) e total para vancomicina. Entre os 18 sorotipos mais frequentes, 9V e 14 apresentaram menor suscetibilidade a SMT, penicilina e ceftriaxona; 19A a SMT e penicilina; 1 a SMT; 12F e 3 a cloranfenicol; 6A a SMT; 6B a eritromicina e 23F a penicilina. Conclusão: O monitoramento da resistência antimicrobiana do Streptococcus pneumoniae é fundamental para direcionar o tratamento empírico das doenças pneumocócicas.

Prevalence of pneumococcal serotypes and resistance to antimicrobial agents in patients with meningitis: ten-year analysis

OBJECTIVES: To determine the prevalence of pneumococcal serotypes and antimicrobial susceptibility in patients with meningitis, and to evaluate the implications for vaccine coverage. METHODS: Pneumococcal strains obtained from normally sterile fluids from patients admitted with meningitis were isolated at the Hospital de Clínicas of the Universidade Federal de Uberlândia, Minas Gerais State, and sent to the Instituto Adolfo Lutz, city of São Paulo, São Paulo State, for further identification, serotyping, and antimicrobial susceptibility determination. RESULTS: From April 1999 to April 2009, 338 pneumococcal strains were isolated, and 72 obtained from patients with meningitis, were analyzed. Patients' ages varied from one month to 82.2 years (mean of 18.4 ± 22.9 years; median of 5.2 years) and 46 (63.9 percent) patients were male. Strains were isolated from cerebrospinal fluid [66 occasions (91.7 percent)] and blood [6 occasions (8.3 percent)]. The most commonly identified serotypes were 14, 19F, 3, 7F, 6A, 6B, 10A, 18C, 23F, 5, and 34. Of the 20 [27.8 percent] oxacillin-resistant strains, 17 [23.6 percent] were resistant to penicillin and nine [12.5 percent] to ceftriaxone, both resistance patterns being more common in children aged two years or less and during the 2005-2009 period. CONCLUSIONS: Resistance to penicillin and ceftriaxone was detected in 23.6 percent and 12.5 percent of the strains, respectively, and predominated in children aged two years or less and during the 2005-2009 period. There were 24 different serotypes of pneumococcus and 79.8 percent of the serotypes were represented in the 7-valent conjugated vaccine [PVC7].

Prevalência de sorotipos e resistência antimicrobiana de cepas invasivas do pneumococo em crianças: análise de 9 anos / Prevalence of serotypes and antimicrobial resistance of invasive strains of pneumococcus in children: analysis of 9 years

OBJETIVO: Avaliar o perfil de sorotipos e a sensibilidade aos antimicrobianos de cepas de pneumococo obtidas de crianças e as implicações na formulação de vacinas pneumocócicas. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia (MG), a partir de pacientes com doença invasiva, foram enviadas ao Instituto Adolfo Lutz, São Paulo (SP), para confirmação da identificação, sorotipagem e determinação da sensibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a dezembro de 2008, foram avaliadas 142 cepas de pneumococo obtidas de crianças de até 5 anos de idade. Setenta e cinco (52,8 por cento) eram de pacientes do sexo masculino, e a idade variou de 1 a 60 meses (média de 19±15,4 meses e mediana de 15 meses). Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia [92 casos (64,8 por cento)] e meningite [33 casos (23,2 por cento)], e as principais fontes de recuperação foram sangue [61 amostras (43 por cento)], líquido pleural [52 (36,6 por cento)] e liquor [28 (19,7 por cento)]. Os sorotipos mais comuns foram o 14, 5, 6B, 1, 6A, 18C, 19A, 3, 9V, 19F, 23F, 9N e 10A. Foram detectadas 14 (9,9 por cento) cepas penicilina-resistentes, restritas aos sorotipos 14, 6B, 19F, 19A e 23F e predominantes no período de 2004 a 2008 (p = 0,000). Foi detectada sensibilidade diminuída ao cotrimoxazol (79,5 por cento), à eritromicina e à clindamicina (11,3 por cento cada) e à ceftriaxona (5,6 por cento). CONCLUSÕES: A resistência à penicilina foi detectada em 9,9 por cento das cepas e predominou no período de 2004 a 2008. Foram identificados 20 diferentes sorotipos de pneumococo, e a cifra de cobertura pela vacina 7-valente atualmente disponível (PN CRM7) é de 71,9 por cento.

OBJECTIVE: To determine the prevalence of serotypes and antimicrobial susceptibility of strains of pneumococcus in children and to evaluate the implications for vaccine formulation. METHODS: Strains of pneumococcus obtained from children admitted with invasive diseases were isolated at Hospital de Clínicas of Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, Brazil, and sent to Instituto Adolfo Lutz, São Paulo, Brazil, for further identification, serotyping, and determination of antimicrobial susceptibility. RESULTS: From April 1999 to December 2008, 142 strains of pneumococcus, obtained from children under 5 years of age, were analyzed. Seventy-five (52.8 percent) patients were male, and the age ranged from 1 to 60 months (mean age = 19±15.4 months; median = 15 months). The most common diagnoses were pneumonia [92 cases (64.8 percent)] and meningitis [33 cases (23.2 percent)]. The strains were mostly isolated from blood [61 samples (43 percent)], pleural fluid [52 samples (36.6 percent)], and cerebrospinal fluid [28 samples (19.7 percent)]. The most common serotypes were 14, 5, 6B, 1, 6A, 18C, 19A, 3, 9V, 19F, 23F, 9N, and 10A. There were 14 [9.9 percent] penicillin-resistant strains, which was detected only in the following serotypes: 14, 6B, 19F, 19A, and 23F, being predominant from 2004 to 2008 (p = 0.000). There was reduced susceptibility to co-trimoxazole (79.5 percent), erythromycin and clindamycin (11.3 percent each), and ceftriaxone (5.6 percent). CONCLUSIONS: Penicillin resistance was detected in 9.9 percent of the strains, being predominant from 2004 to 2008. Twenty different pneumococcal serotypes were identified, and 71.9 percent of the serotypes were represented in the 7-valent conjugate vaccine (PN CRM7) currently available.

Prevalência de sorotipos e resistência antimicrobiana de cepas invasivas do Streptococcus pneumoniae / Prevalence of serotypes and antimicrobial resistance of invasive strains of Streptococcus pneumoniae

OBJETIVO: Avaliar o perfil de sorotipos e a susceptibilidade aos antimicrobianos de cepas de Streptococcus pneumoniae obtidas em espécimes clínicos de pacientes com doença invasiva, bem como suas implicações na formulaçäo de vacinas pneumocócicas. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no Laboratório de Análises Clínicas do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia a partir de amostras clínicas de pacientes com doença invasiva foram identificadas e enviadas ao Instituto Adolfo Lutz em São Paulo para confirmaçäo da identificaçäo, sorotipagem e determinaçäo da susceptibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a março de 2003, foram isoladas 148 cepas invasivas de pneumococo, sendo 84 (56,7 por cento) provenientes de pacientes do sexo masculino. A idade variou de um dia a 88,83 anos, com média de 21,33+25,82 anos e mediana de 4,42 anos. Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia (91 casos; 61,4 por cento), meningite (32 casos; 21,6 por cento) e bacteremia sem foco evidente (15 casos; 10,1 por cento). As principais fontes de recuperaçäo foram sangue (76 amostras; 51,3 por cento), líquido pleural (39; 26,3 por cento) e liquor (30; 20,2 por cento). No total, foram identificados 23 diferentes sorotipos entre 143 amostras testadas, sendo os mais comuns os seguintes: 14, 3, 1, 5, 6A, 6B e 18C. Dentre 30 (20,2 por cento) cepas oxacilina-resistentes, 23 (15,5 por cento) confirmaram a resistência à penicilina (12,8 por cento com nível intermediário e 2,7 por cento, com nível pleno), que esteve restrita aos sorotipos 14, 23F, 19A e 6B, predominando em indivíduos com até dois anos de idade (p = 0,0008). Foi detectada susceptibilidade diminuída ao cotrimoxazol (63,4 por cento), à eritromicina (8,3 por cento), à clindamicina (8,7 por cento) e à ofloxacina (0,8 por cento). A resistência à cefotaxima foi detectada em três das 30 cepas testadas (2 por cento das 148), todas elas com resistência confirmada à penicilina. Näo foi observada resistência a cloranfenicol, rifampicina ou vancomicina. CONCLUSÕES: A resistência à penicilina foi detectada em 15,5 por cento das cepas e predominou em crianças abaixo de dois anos de idade. Foram identificados 23 diferentes sorotipos de Streptococcus pneumoniae em pacientes internados com doença invasiva, e a maioria dos sorotipos (82,6 por cento) e das cepas (90,2 por cento) está incluída na vacina polissacarídica 23-valente

Empiemas pleurais pneumocócicos: distribuição dos sorotipos de Streptococcus pneumoniae e sensibilidade à penicilina / Pneumococcic pleural empyema: streptococcus pneumoniae serotypes and their sensitivity to penicillin

Estudo prospectivo de 50 crianças portadoras de empiema pleural pneumocócico adquirido na comunidade, hospitalizadas no Departamento de Pediatria da Santa Casa de São Paulo, no período de janeiro de 1998 a dezembro de 2000. Foram identificados os sorotipos dos Streptococcus pneumoniae e sua sensibilidade à penicilina. Observou-se que os empiemas pleurais pneumocócicos ocorreram em número significativo durante todo o ano, 50 por cento dos casos em crianças menores de 2 anos e predomínio do sexo masculino. O melhor local para o isolamento do Streptococcus pneumoniae foi o líquido pleural, sendo responsável por 86,0 por cento dos isolados. Os sorotipos de Streptococcus pneumoniae isolados foram em ordem decrescente de freqüência: 14 = 23 casos; 1 = 10 casos; 5 = 7 casos; 4 = 3 casos; 6B = 2 casos e os sorotipos 3, 8, 9V, 15A, e 23F com um caso cada. Os sorotipos 14, 1 e 5 foram responsáveis por 80,0 por cento dos isolados, dados estes que se assemelham a outros estudos realizados na cidade de São Paulo em pacientes com pneumonia. Resistência à penicilina foi identificada em oito cepas (16,0 por cento), sendo sete (14 por cento) moderadamente resistentes e uma (2 por cento) com resistência plena. Dos Streptococcus pneumoniae resistentes, 6/8 dos casos foram do sorotipo 14 e os sorotipos 1 e 6B com um caso cada.

Catalase-negative, methicillin-resistant Staphylococcus aureus as a cause of septicemia

A catalase-negative methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) was isolated from blood, venous catheter spike and bone marrow collected from an HIV-positive man with lobar pneumonia and sepsis after ten days of hospitalization. The isolate was resistant to oxacillin (positive for penicillin-binding protein 2'), ceftriaxone, clindamycin and clarithromycin, and susceptible to vancomycin. This is the first case of septicemia due to a catalase-negative S. aureus reported in Brazil, and, to our knowledge, it is the first case of catalase-negative MRSA reported in the literature. We believe that the patient acquired the S. aureus infection within the hospital environment since it was isolated ten days after hospitalization, it was isolated in a venous catheter spike, and the antibiotic resistance profile is similar to other S. aureus isolates recovered from infections in our hospital

Menigite Pneumocócica na infância: características clínicas, sorotipos mais prevalentes e prognóstico / Pneumococcal meningitis in children: clinical findings, most frequent serotypes and outcome

Objetivo: Avaliar letalidade, morbidade, resistência bacteriana e sorotipos mais freqüentes em crianças internadas por meningite bacteriana. Métodos: selecionamos crianças com meningite bacteriana com cultura positiva para S. pneumoniae, entre 1 mês e 15 anos, internadas em dois hospitais em São Paulo, e analisamos dados clínicos e microbiológicos. A identificação do S. pneumoniae foi realizada através do teste de optoquina e solubilidade em bile. Todas as cepas foram testadas com disco de oxacilina 1µg e, nas cepas que apresentaram alo de inibição <20mm, foi avaliada a concentração inibitório mínima para penicilina, cloranfenicol, eritromicina, ceftriaxona, vancomicina e trimetroprim/sulfametoxazole pelo método do E-teste. As cepas de pneumococo foram sorotipadas através da reação de Quellung. A evolução clínica dos pacientes foi analisada através de revisão retrospectiva dos prontuários, com uso de um protocolo uniforme de avaliação. Resultados: incluimos 55 pacientes com meningite pneumocócica, sendo que 52,5 por cento delas apresentava idade menor de 6 meses. Das cepas isoladas, 36 por cento apresentavam infecção por cepa com resistência intermediária à penicilina (0,1µg/ml menor ou igual CIM menor ou igual 1,0µg/ml). Das cepas com susceptibilidade diminuída à penicilina, 35 por cento era resistente à trimetoprim/sulfametoxazole. Não houve resistência aos outros antibióticos testados. A letalidade foi de 20 por cento, e houve seqüelas neurológicas em 40 por cento das crianças avaliadas. Houve correlação estatisticamente significante entre letalidade e alteração neurológica com idade abaixo de 6 meses. Os sorotipos do pneumococo mais freqüentemente encontrados foram 1, 5, 6B, 14, 19A, 23F, sendo que 70 por cento dos sorotipos encontrados estão presentes na vacina heptavalente, recentemente liberada. Conclusão: meningite pneumocócica apresenta alta letalidade e alta morbidade, e a vacina heptavalente tem utilidade potencial na sua prevenção

Community acquired Pneumonia among pediatric outpatients in Salvador, northeast Brazil, with emphasis on the role of pneumococcus

Pneumonia is one of the leading causes of hospitalization and death among children in developing counties,, and mortality due to pneumoniae has been associated with S. pneumoniae infection. This investigation was designed to describe the antimicrobial susceptibility and serotype patterns of pneumococcal strains recovered from the blood of children with community-acquired pneumonia (CAP) and to acess the clinical findings of pneumococcal bacteremic patients with pneumonia. In a 26 month prospective study, blood cultures were obtained as often as possible from children(<16 years of age) diagnosed with CAP in two emergency rooms. Antimicrobial drug susceptibility tests and serotyping were performed when pneumococcus was identified. We studied 3,431 cases and cultured blood samples from 65.5 percent of those. Pneumococcus was recovered from 0.8 percent of the blood samples. The differences in age, somnolence, wheezing and hospitalization among children with and without pneumococcal bacteremia were statistically significant. Pneumococcal bacteremia was age-related (mean 1.63 +1.55; median 0.92) and associated with somnolence and hospitalization among children with CAP. One strain was recovered from pleural fluid. Penicillin resistance was detected in 21.0 percent(4/19) of the strains at an intermediate level, whereas 63.0 percent of the strains were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole. The most common serotypes were 14 and 6B, and these serotypes included the resistant strains. Eight of our 18 isolates from blood were of types included in the heptavalent conjugate pneumococcal vaccine, recently licensed in the USA.

Considerações sócio-nosológicas em população de baixa renda submetida a exame ecodopplercardiográfico em instituição médica no Rio de Janeiro / Social nosological considerations about low income population submitted to echodopplercardiographic exam in medical institution in Rio de Janeiro

Os autores mostram a sua experiência em levar a ecodopplercardiografia às populações de baixa renda, situadas na Zona Oeste do Rio de Janeiro e municípios da Baixada Fluminense. Revelam a alta incidência de hipertensão arterial (46por cento) como principal indicação para o procedimento, em 4.297 exames realizados de junho de 1996 a março de 1997, e ressaltam a importância deste tipo de avaliação, a baixo custo, para estas comunidades

Primary community-acquired pneumonia by Escherichia coli: case report and review of the literature

Lactente de dois anos, sexo feminino, convulsiva cronica, foi admitida por pneumonia com seis dias de evolucao. Ao RX: pneumonia lobar superior direita. Colhidas culturas de liquido pleural e sangue e iniciados oxacilina e cloranfenicol. Apesar do tratamento, a crianca foi a obito no terceiro dia de internacao. Os resultados das culturas colhidos a admissao (liquido pleural e sangue), foram positivos para Escherichia coli. Nenhum outro foco foi identificado. Os autores discutem os aspectos clinicos e fisiopatologicos da pneumonia por Escherichia coli, e fazem uma revisao bibliografica sobre o tema